2020年4月14日火曜日

パラディレプタス属の一種

これはよく見かける大型の繊毛虫で、以前トラケリウス属と思っていたものですが、よく調べるとパラディレプタス属だったようです。
象の鼻のような吻部を持ち、くるくる回転しながら活発に泳ぎます。まずその動画から。

これは繊毛虫の運動を妨げないように水の層を厚くして撮影したものです。

次は細部を見るためにある程度カバーガラスで押さえつけて撮っています。


細胞の後端近くに数珠状に並んでいるのは大核だと思います。油滴のように見える球はやはり脂肪でしょうか。

細胞の表層近くに多数の収縮胞が並んでいます。


カバーガラスに押えられた繊毛が写っています。

これで細胞の表面にピントが合っている状態だと思いますが、この粒々は何でしょうか。

さらに内部にピントをずらすと大核が見えてきます。

動画です。


(2020.03.14・明石公園 桜堀にて採集)


2020年4月13日月曜日

ネスイムシ科の一種

朽木の樹皮下からホソカタムシやチビヒラタムシの仲間と一緒に出てきた小甲虫です。
全身が細かい木屑にまみれていて細部が確認できませんが、上翅が短く末端が裁断状で尾節板が露出していることや、触角の形などからネスイムシ科 Monotomidae の一種と思われます。下の写真では3個体が混ざっていますが、いずれも体長が約2.5mmで、同じ種だと思います。ネスイムシ科の仲間では同じ場所で以前にアナバケデオネスイ Mimemodes cribratus を見つけています。





(2020.04.03・学が丘北公園)


2020年4月12日日曜日

顕微鏡写真に RawTherapee のフラットフィールド機能を

RAWファイルの現像には以前はアドビのCamera Rawを使っていたのですが、現在自分で使っているカメラにはすでにほとんど対応しなくなっていて、かと言って最新バージョンを使うためにCCを購入する気にもならないので数年前からは主にフリーソフトのRawTherapeeのお世話になっています。
これは基本的な色調やコントラスト、シャープネスなどに関して恐ろしく多機能なソフトで、実のところ未だよく理解も出来ず使ってもいない部分も多いのですが、その中にフラットフィールドという機能があります。これが顕微鏡撮影には非常に有用なのですが、せっかく無料で用意されているのにあまり知られていないようなので(新型ウィルス騒動のおかげで時間もあるので)、ここで紹介しておきたいと思います。
これは光学系や照明など被写体以外に起因して画像に現れる明るさや色のムラを取り除くために使われるもので、顕微鏡撮影の場合は照明ムラやコンデンサー・リレーレンズ、センサーのゴミなどの影響を打ち消すのに有効です。ただこの機能が使えるのはRAWファイルに限定されますが、色調やコントラストなど他の調整を施した後でも適用できます。


使い方は簡単です。まず補正したい画像を撮影した後、プレパラートを動かして何もない空白の部分を探します。と言っても完全にゴミもチリもないという状態はまず望めないので、ごく小さなものなら我慢します。そしてそのごく小さなゴミが見えなくなる程度に少しピントを外しますが、外す量が大きすぎると照度分布が変わるのでよくありません。その状態で撮影したものを補正用の画像として使用するのですが、その間コンデンサーの位置や絞り、カメラの角度など一切動かしてはいけません。露出も変わらないように、マニュアル設定の方が良いでしょう。
後は補正したい画像をRawTherapeeで開き、フラットフィールド機能を選んで、補正用の画像を適用するだけです。以下は作例です。

これが補正前の画像です。オリンパスBHCに短鏡胴のプランアクロマート40/0.65で偏斜照明、ニコンのHKW10Xにマイクロニッコール55mm F3.5をつけたD7000でのコリメート撮影です。盛大に出ている大小の影はコンデンサーやリレーレンズ、撮影レンズなどのゴミや傷によるものでしょう。被写体はMWSさんの珪藻プレパラートです。

同じ条件でもう1枚。

そしてこれが補正用画像。

補正後の画像です。偏斜による照明ムラや、ゴミ・チリの影が見事に消えています。

もう1枚も。

次はコンデンサを目一杯絞った画像です。通常ここまで極端に絞ることはありませんが、コリメート撮影でよく出る同心円状のムラや青っぽいハレーションが見えます。

上の補正用画像。

補正してかなりすっきりしました。まだ残っている黒い斑点はカバーガラスやスライドガラスに付着したゴミで、これはこの機能では取れません。

最後に少し補足説明を。フラットフィールド補正の調整項目にある「ぼかし半径は」デフォルトでは32となっていますが、この設定では小さな影は取り切れないので、0かそれに近い数値にした方がよいでしょう。この数値を小さくすると補正用画像のノイズを拾う可能性が高くなるそうですが、実際に試してみるとISO100や200の常用感度ではまず影響はないようです。被写体によって高ISOで撮影する必要がある場合も補正用画像の方はISO値を低くして撮影しておけば問題ないでしょう。

以上のように大変重宝な機能なのですが、実は私自身はそれほど使っていません。動き回る動物プランクトンを元気なうちにと倍率や絞りを変えながらどんどん撮影していく場合が多いので、補正用画像の撮影が追い付かないからです。撮影後、照明ムラやゴミの目立つ画像を見ながら後悔することも多いのですが。他には、昔のネガやポジの複写をする際の照明ムラの補正に使っています。

RawTherapeeは他にも面白い機能が多く、例えば「詳細レベルによるコントラスト調整」では特定の周波数域のコントラスト調整が出来て珪藻の条線の表現などに役立ちそうだし、長時間露光によるノイズをキャンセルするダークフレーム補正などは普通天体画像用ソフトにしか備わっていないものです。

RawTherapeeのダウンロードはこちら。頻繁にアップデートを繰り返して最新型のカメラにも次々と対応してくれています。またこのソフトのマニュアルであるRawPedia(日本語)はこちら。かなり専門的な解説が多く私のような素人にはかなり難物ですが、読んでいると勉強になることが多々あります。




2020年4月8日水曜日

クロヒラタケシキスイ

これは朽木などでよく見かける小甲虫で、クロヒラタケシキスイ Ipidia variolosa だと思います。


原色日本甲虫図鑑(Ⅲ)の説明には、「上翅は間室に微細印刻を有し、第7間室は隆まって稜をなす」とあります。



裏返しました。体長は約4.8mmです。

(2020.04.03・学が丘北公園)





2020年4月7日火曜日

ヤリタカラダニの一種(Calyptostoma sp.)

朽木の樹皮を捲ると赤いダニが出てきました。調べてみるとヤリタカラダニ科の一種のようです。幼虫がガガンボ類に寄生するそうで、その様子はBABAさんのブログでも紹介されていました。
「日本産土壌動物検索図説」ではこの科の特徴として成虫の体長は2mm内外、鋏角が体内に出し入れできる、眼は2対、感覚毛は1対、背板も背溝もなし、毛は木の葉状、などが挙げられています。国内で記載されているのはコノハヤリタカラダニ Calyptostoma velutinus 1種のみだそうです。

最初の個体は体長約1.5mm。背中に大量の水滴を乗せていました。

のろのろと歩きはじめます。



水滴が邪魔をして見えにくいですが、左右の目の中間やや下方に細い感覚毛がどうにか認められます。

2匹目は体長約2mmで、丸々と太っています。



感覚毛の基部。2対の眼は上下に接しています。

背毛は木の葉状ということですが、この画像では少し太めというくらいにしか見えません。またそれぞれの毛穴をつなぐ畝のような盛り上がりがあって規則的な網目模様を作っています。このあたりの様子は「日本ダニ類図鑑」のコノハヤリタカラダニの背毛の図とはやや異なるようです。

裏返してみました。最初この写真を見た時、口器らしきものがどこにも見えないので慌てましたが、鋏角が自由に出し入れできるという説明で納得しました。

ぬいぐるみにしたいような姿です。

(2020.04.03・学が丘北公園)



2020年4月3日金曜日

タイワントガリキジラミ幼虫とヒメコバチの一種

昨日の記事と同じモチノキですが、たくさんのタイワントガリキジラミに寄生された葉の裏でヒメコバチが1匹歩きまわっていました。寄生卵を産みこむのに適した寄主を探しているのだろうと思いしばらく追いかけましたが、それが悪かったのか産卵には至らずやがて飛び去ってしまいました。1月にカシトガリキジラミの幼虫に産卵していたものと写真を見る限りでは区別がつかず、同種かも知れません。


体長は約1.5mm、翅端まで約2mmです。



(2020.03.30・明石公園)